BAM@HD VN:1.5 SO:coordinate @SQ SN:chr1 LN:195471971 @SQ SN:chr2 LN:182113224 @SQ SN:chr3 LN:160039680 @SQ SN:chr4 LN:156508116 @SQ SN:chr5 LN:151834684 @SQ SN:chr6 LN:149736546 @SQ SN:chr7 LN:145441459 @SQ SN:chr8 LN:129401213 @SQ SN:chr9 LN:124595110 @SQ SN:chr10 LN:130694993 @SQ SN:chr11 LN:122082543 @SQ SN:chr12 LN:120129022 @SQ SN:chr13 LN:120421639 @SQ SN:chr14 LN:124902244 @SQ SN:chr15 LN:104043685 @SQ SN:chr16 LN:98207768 @SQ SN:chr17 LN:94987271 @SQ SN:chr18 LN:90702639 @SQ SN:chr19 LN:61431566 @SQ SN:chrX LN:171031299 @SQ SN:chrY LN:91744698 @PG ID:bowtie2 PN:bowtie2 VN:2.5.1 CL:"/software/sit/EasyBuild/software/Bowtie2/2.5.1-GCC-13.2.0/bin/bowtie2-align-s --wrapper basic-0 -X 2000 -p 4 -t -x /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/indexes/mm10/mm10 -S /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/02_map_files/mm10/ESC_w2_lib_19427.sam -1 pools/ESC_w2_lib_19427_R1.fastq.gz -2 pools/ESC_w2_lib_19427_R2.fastq.gz" @PG ID:samtools PN:samtools PP:bowtie2 VN:1.20 CL:samtools view -hF 0x4 /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/02_map_files/mm10/ESC_w2_lib_19427.sam @PG ID:samtools.1 PN:samtools PP:samtools VN:1.20 CL:samtools sort -o /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/02_map_files/mm10/ESC_w2_lib_19427.bam /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/02_map_files/mm10/ESC_w2_lib_19427_unireads.sam @PG ID:samtools.2 PN:samtools PP:samtools.1 VN:1.20 CL:samtools view -h -b -s 0.999999999999999 -o /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/02_map_files/mm10/ESC_w2_lib_19427_DOWN.bam /no_backup/ldicroce/eblanco/molbio/02_map_files/mm10/ESC_w2_lib_19427.bam chr1cª¦ chr2ÈÓÚ chr3Š chr4ÔT chr5<Ð chr6bÌìchr7³B«chr8}¶chr9¦+mchr10Q?Êchr11ïÔFchr12þ)chr13}-chr14dÛqchr15¥”3chr16ˆÚchr17d©chr18/hchr19_©chrX»1 chrYºéw