SampleID	chrom	degradation_ratio
S-T2	apiPro-TGG-1	0.764705882352941
S-R1	apiGly-ACC-1	0.75
S-R1	apiSer-GCT-1	0.75
S-S1	apiSer-GCT-1	0.75
S-T1	apiMet-CAT-1	0.666666666666667
S-T2	apiGlu-TTC-1	0.625
S-T2	apiGly-ACC-1	0.615384615384615
S-R1	apiArg-TCT-1	0.6
S-R1	apiIle-GAT-1	0.6
S-R2	apiLeu-TAG-1	0.6
S-T1	apiVal-TAC-1	0.6
S-R1	apiSer-TGA-1	0.571428571428571
S-S2	apiSer-GCT-1	0.571428571428571
S-S2	apiMet-CAT-1	0.538461538461538
S-R1	apiLeu-TAG-1	0.5
S-R2	apiAsp-GTC-1	0.5
S-R2	apiPhe-GAA-1	0.5
S-S1	apiGlu-TTC-1	0.5
S-T1	apiGly-TCC-1	0.5
S-T2	apiAsp-GTC-1	0.5
S-T2	apiSer-GCT-1	0.5
S-T2	SeC-TCA-1	0.47029702970297
S-T2	apiTrp-CCA-1	0.466666666666667
S-R2	apiGlu-TTC-1	0.461538461538462
S-T2	apiHis-GTG-1	0.461538461538462
S-S1	apiGly-ACC-1	0.441176470588235
S-T1	apiGlu-TTC-1	0.428571428571429
S-R1	apiAla-TGC-1	0.421052631578947
S-R1	apiTrp-CCA-1	0.4
S-R1	apiTyr-GTA-1	0.4
S-R1	SeC-TCA-1	0.4
S-R2	apiSer-GCT-1	0.4
S-S1	apiPhe-GAA-1	0.4
S-T1	apiLeu-TAG-1	0.4
S-T2	apiPhe-GAA-1	0.4
S-T2	apiSer-TGA-1	0.4
S-T2	apiVal-TAC-1	0.4
S-T1	SeC-TCA-1	0.398809523809524
S-R1	apiPhe-GAA-1	0.391304347826087
S-T2	Thr-TGT-1	0.384868421052632
S-R1	apiLys-TTT-1	0.384615384615385
S-R1	apiPro-TGG-1	0.384615384615385
S-S1	His-GTG-1	0.380959137343927
S-R2	apiVal-TAC-1	0.375
S-S1	apiArg-ACG-1	0.375
S-S1	apiIle-GAT-1	0.375
S-T2	apiCys-GCA-1	0.375
S-T2	apiGly-TCC-1	0.375
S-S2	apiPhe-GAA-1	0.373134328358209
S-T2	apiAla-TGC-1	0.368421052631579
S-S1	Thr-TGT-1	0.368055555555556
S-T1	apiGly-ACC-1	0.363636363636364
S-T1	apiPro-TGG-1	0.363636363636364
S-T2	apiLys-TTT-1	0.363636363636364
S-S1	SeC-TCA-1	0.361111111111111
S-S1	apiHis-GTG-1	0.36
S-R2	apiAsn-GTT-1	0.358974358974359
S-S2	apiHis-GTG-1	0.358974358974359
S-S1	Arg-TCT-1	0.358764759309718
S-S2	His-GTG-1	0.356168217759429
S-R1	His-GTG-1	0.3546875
S-T2	His-GTG-1	0.352956232403379
S-R1	Ala-AGC-1	0.349775784753363
S-R1	Lys-CTT-1	0.348360655737705
S-R1	Ile-TAT-1	0.348066298342541
S-T2	Ile-AAT-1	0.345924453280318
S-T1	His-GTG-1	0.342837928715535
S-R2	apiPro-TGG-1	0.342105263157895
S-S1	apiPro-TGG-1	0.34
S-R1	apiGly-TCC-1	0.333333333333333
S-R1	apiHis-GTG-1	0.333333333333333
S-R1	apiMet-CAT-1	0.333333333333333
S-R1	apiVal-TAC-1	0.333333333333333
S-R2	apiArg-ACG-1	0.333333333333333
S-R2	apiMet-CAT-1	0.333333333333333
S-R2	apiSer-TGA-1	0.333333333333333
S-R2	apiTyr-GTA-1	0.333333333333333
S-S1	apiLeu-TAG-1	0.333333333333333
S-S1	apiVal-TAC-1	0.333333333333333
S-T2	apiArg-ACG-1	0.333333333333333
S-T2	apiArg-TCT-1	0.333333333333333
S-T2	apiIle-GAT-1	0.333333333333333
S-T2	apiLeu-TAG-1	0.333333333333333
S-S1	Val-AAC-1	0.330530973451327
S-R1	Ala-CGC-1	0.329268292682927
S-R1	Arg-TCT-1	0.328436516264428
S-S1	apiTrp-CCA-1	0.325581395348837
S-T2	Lys-CTT-1	0.323963457484188
S-S1	Lys-CTT-1	0.323432343234323
S-T1	Ile-AAT-1	0.321799307958477
S-S1	apiThr-TGT-1	0.32
S-T1	Lys-CTT-1	0.318635607321131
S-S1	Ala-AGC-1	0.318158826504805
S-T1	Thr-TGT-1	0.315533980582524
S-R1	Thr-TGT-1	0.313253012048193
S-R1	apiAsn-GTT-1	0.3125
S-R2	SeC-TCA-1	0.312
S-R2	His-GTG-1	0.311011689998557
S-S2	apiTrp-CCA-1	0.310344827586207
S-T2	Arg-TCT-1	0.308476960956736
S-T1	Arg-TCT-1	0.308132875143184
S-S1	Trp-CCA-1	0.306547619047619
S-T2	Ile-TAT-1	0.305203938115331
S-S1	apiMet-CAT-2	0.304878048780488
S-T1	Ile-TAT-1	0.304147465437788
S-R2	apiArg-TCT-1	0.3
S-S1	apiAsp-GTC-1	0.3
S-T2	apiThr-TGT-1	0.3
S-T1	Ala-AGC-1	0.298260869565217
S-S2	apiTyr-GTA-1	0.297297297297297
S-R2	apiGly-ACC-1	0.296296296296296
S-S1	apiSer-TGA-1	0.296296296296296
S-S1	Glu-CTC-1	0.291245429124543
S-S1	Arg-TCG-1	0.28988326848249
S-S1	Thr-CGT-1	0.289156626506024
S-R1	Thr-CGT-1	0.28735632183908
S-R1	apiMet-CAT-2	0.285714285714286
S-T1	apiHis-GTG-1	0.285714285714286
S-S2	Thr-TGT-1	0.283950617283951
S-S1	Ala-CGC-1	0.282758620689655
S-R1	Trp-CCA-1	0.282571912013536
S-S1	apiAla-TGC-1	0.282051282051282
S-S2	apiThr-TGT-1	0.28169014084507
S-S2	Arg-TCT-1	0.281109185441941
S-T1	Ala-CGC-1	0.27906976744186
S-S1	Ile-TAT-1	0.27893175074184
S-S2	apiLeu-TAG-1	0.277777777777778
S-T1	apiPhe-GAA-1	0.277777777777778
S-R2	Ile-TAT-1	0.277027027027027
S-S2	Val-AAC-1	0.276644863409003
S-T2	apiAsn-GTT-1	0.272727272727273
S-S2	apiAsn-GTT-1	0.267716535433071
S-T2	Ala-AGC-1	0.267048604694142
S-S2	SeC-TCA-1	0.266891891891892
S-R2	apiThr-TGT-1	0.266666666666667
S-S1	apiAsn-GTT-1	0.266666666666667
S-R2	apiAla-TGC-1	0.265822784810127
S-T1	Trp-CCA-1	0.2648835202761
S-T1	Val-AAC-1	0.26472471190781
S-S2	Ile-TAT-1	0.264084507042254
S-R1	Glu-CTC-1	0.263841998649561
S-T1	Leu-TAA-1	0.26321036889332
S-S2	apiAsp-GTC-1	0.263157894736842
S-S2	apiPro-TGG-1	0.263157894736842
S-S1	Leu-TAA-1	0.262372881355932
S-T1	apiMet-CAT-2	0.260869565217391
S-R2	apiGly-TCC-1	0.259259259259259
S-R1	Val-AAC-1	0.258765778401122
S-S1	apiGln-TTG-1	0.257142857142857
S-R2	Arg-TCT-1	0.25376762275158
S-S2	apiGln-TTG-1	0.253164556962025
S-S2	Trp-CCA-1	0.251696483652067
S-T1	Arg-ACG-1	0.250549450549451
S-R1	apiGln-TTG-1	0.25
S-S1	apiMet-CAT-1	0.25
S-S2	apiArg-TCT-1	0.25
S-T1	apiAsn-GTT-1	0.25
S-T1	apiAsp-GTC-1	0.25
S-T1	apiSer-TGA-1	0.25
S-T1	apiTrp-CCA-1	0.25
S-T1	apiTyr-GTA-1	0.25
S-T2	Trp-CCA-1	0.248651079136691
S-S1	apiLys-TTT-1	0.24390243902439
S-S2	Thr-CGT-1	0.243523316062176
S-S2	Lys-CTT-1	0.243183492999263
S-S2	apiAla-TGC-1	0.243093922651934
S-R2	Thr-TGT-1	0.240740740740741
S-S1	apiArg-TCT-1	0.24
S-S2	Ala-CGC-1	0.24
S-R1	Leu-TAA-1	0.238255033557047
S-S2	apiSer-TGA-1	0.238095238095238
S-S2	Ala-AGC-1	0.237241124260355
S-T2	Val-AAC-1	0.2371875
S-S1	Thr-AGT-1	0.236144578313253
S-S2	apiGlu-TTC-1	0.235294117647059
S-R2	Val-AAC-1	0.232837379274341
S-T1	Glu-CTC-1	0.232665330661323
S-T2	Ala-CGC-1	0.231671554252199
S-T2	apiMet-CAT-2	0.230769230769231
S-R1	Thr-AGT-1	0.229411764705882
S-S2	apiGly-ACC-1	0.228070175438596
S-T1	Thr-AGT-1	0.227454110135674
S-T2	Glu-CTC-1	0.225972766932534
S-S2	Glu-CTC-1	0.225850673194614
S-R2	apiLys-TTT-1	0.225806451612903
S-S2	Leu-TAA-1	0.224226804123711
S-T1	apiArg-TCT-1	0.222222222222222
S-S1	Met-CAT-1	0.221789883268482
S-S1	Gly-TCC-1	0.220839096357769
S-R1	Arg-TCG-1	0.220472440944882
S-T2	Leu-TAA-1	0.217102137767221
S-T1	apiGln-TTG-1	0.214285714285714
S-R2	Lys-CTT-1	0.213973799126638
S-R2	Ala-AGC-1	0.21310507674144
S-T2	Arg-ACG-1	0.210428305400372
S-R2	Trp-CCA-1	0.210048848569435
S-R2	apiMet-CAT-2	0.208955223880597
S-R2	apiGln-TTG-1	0.208333333333333
S-S1	apiCys-GCA-1	0.206896551724138
S-R1	Met-CAT-1	0.206549118387909
S-S1	Gly-GCC-1	0.20487698671892
S-R2	Ala-CGC-1	0.203636363636364
S-R1	Asp-GTC-1	0.202104759626884
S-T2	Asp-GTC-1	0.201199285532023
S-T1	Thr-CGT-1	0.200542005420054
S-R1	apiCys-GCA-1	0.2
S-R1	apiGlu-TTC-1	0.2
S-S2	apiGly-TCC-1	0.2
S-S2	apiVal-TAC-1	0.2
S-T1	apiLys-TTT-1	0.2
S-R2	Thr-CGT-1	0.199233716475096
S-S1	Asp-GTC-1	0.19918533604888
S-R2	Glu-CTC-1	0.199123127511874
S-R1	Asn-GTT-1	0.196280991735537
S-T1	Met-CAT-1	0.196230598669623
S-T1	Leu-CAG-1	0.195729537366548
S-T2	Gly-TCC-1	0.19432291110874
S-R1	Gly-TCC-1	0.192826841496336
S-S2	Gly-TCC-1	0.192389758179232
S-T2	Thr-AGT-1	0.191276931161324
S-S1	Arg-ACG-1	0.190972222222222
S-S1	Tyr-GTA-1	0.190067443286327
S-R1	Ser-CGA-1	0.19
S-R1	Gln-CTG-1	0.18942731277533
S-R2	apiHis-GTG-1	0.1875
S-T1	Arg-TCG-1	0.186046511627907
S-S1	Ser-CGA-1	0.185882352941176
S-S2	Arg-ACG-1	0.185815602836879
S-R1	Arg-ACG-1	0.185286103542234
S-S2	Asp-GTC-1	0.184408945686901
S-R1	Arg-CCT-1	0.183908045977011
S-S2	apiLys-TTT-1	0.183908045977011
S-T2	Thr-CGT-1	0.182711198428291
S-T1	Gln-CTG-1	0.181660899653979
S-T1	Gly-TCC-1	0.180971843778383
S-S1	Leu-CAG-1	0.180769230769231
S-R2	Ile-AAT-1	0.180616740088106
S-S1	Phe-GAA-1	0.179693206720234
S-S2	apiIle-GAT-1	0.179487179487179
S-R1	iMet-CAT-1	0.179179179179179
S-R1	Ile-AAT-1	0.178571428571429
S-R1	Phe-GAA-1	0.178033658104517
S-T2	Leu-AAG-1	0.176361386138614
S-T2	Arg-TCG-1	0.175696594427245
S-S1	Asn-GTT-1	0.175550405561993
S-S2	Arg-TCG-1	0.175292153589316
S-T1	Ser-CGA-1	0.175029171528588
S-T2	Met-CAT-1	0.174517374517375
S-S2	Thr-AGT-1	0.17431693989071
S-T2	Ser-CGA-1	0.173501577287066
S-T1	Leu-AAG-1	0.173272933182333
S-R1	Gln-TTG-1	0.171529619805482
S-R1	Leu-CAG-1	0.168674698795181
S-S1	Ser-GCT-1	0.168090638930163
S-S1	Gln-TTG-1	0.167516139993204
S-R2	Gln-CTG-1	0.167388167388167
S-S1	apiGly-TCC-1	0.166666666666667
S-T1	apiThr-TGT-1	0.166666666666667
S-T2	apiTyr-GTA-1	0.166666666666667
S-T1	Asp-GTC-1	0.165926152903325
S-S2	Ile-AAT-1	0.164983164983165
S-T1	Phe-GAA-1	0.164605873261206
S-T1	iMet-CAT-1	0.164567954841511
S-S2	Met-CAT-1	0.164247517188694
S-R2	Arg-TCG-1	0.162633107454017
S-R1	Leu-AAG-1	0.161369193154034
S-R2	apiTrp-CCA-1	0.16
S-S1	Gln-CTG-1	0.159090909090909
S-R2	Arg-ACG-1	0.158730158730159
S-R2	Leu-TAA-1	0.158156028368794
S-R2	Asp-GTC-1	0.157711551011529
S-S1	iMet-CAT-1	0.157678056813503
S-S1	Arg-CCT-1	0.156880733944954
S-S1	Leu-CAA-1	0.156224572823434
S-S1	Ser-AGA-1	0.15609022556391
S-R1	Ser-GCT-1	0.155253837072019
S-R2	Ser-CGA-1	0.154772937905468
S-T2	Leu-CAG-1	0.154198473282443
S-T2	Ser-AGA-1	0.15369232966719
S-S2	Leu-CAG-1	0.153310104529617
S-T2	Gln-CTG-1	0.153086419753086
S-S2	Ser-CGA-1	0.151848151848152
S-R2	Gly-TCC-1	0.151583346728822
S-T1	Asn-GTT-1	0.151217861975643
S-T1	Tyr-GTA-1	0.15038115038115
S-T2	iMet-CAT-1	0.148998664886515
S-S1	Ala-TGC-1	0.148950276243094
S-R1	Ser-AGA-1	0.148313176320815
S-R2	Leu-CAG-1	0.148230088495575
S-T2	Phe-GAA-1	0.146374045801527
S-S1	Leu-AAG-1	0.145952109464082
S-T2	Asn-GTT-1	0.143445870977968
S-T2	apiGln-TTG-1	0.142857142857143
S-T2	Ser-GCT-1	0.142105618129089
S-T2	Arg-CCT-1	0.141922825376063
S-R2	Thr-AGT-1	0.141650422352177
S-S2	Gly-GCC-1	0.140766416329675
S-S2	Leu-AAG-1	0.138761467889908
S-R2	Phe-GAA-1	0.138670028364324
S-T1	Arg-CCT-1	0.138628158844765
S-T1	Gly-GCC-1	0.137748556767158
S-R1	Gly-GCC-1	0.137616538305634
S-T1	Ser-GCT-1	0.136611030478955
S-R1	Ser-TGA-1	0.136038186157518
S-S1	Ile-AAT-1	0.134259259259259
S-S2	Ser-GCT-1	0.134113847396044
S-T1	Ser-TGA-1	0.134060795011691
S-S2	Phe-GAA-1	0.133680555555556
S-T2	Gly-GCC-1	0.133521858758789
S-S2	apiArg-ACG-1	0.133333333333333
S-R1	Tyr-GTA-1	0.132850241545894
S-S2	Gln-CTG-1	0.131641554321967
S-R2	Ser-GCT-1	0.130973451327434
S-S2	Ser-AGA-1	0.129411764705882
S-T1	Gln-TTG-1	0.12902290518991
S-T1	Ala-TGC-1	0.128865979381443
S-T2	Tyr-GTA-1	0.128817128817129
S-R1	Ala-TGC-1	0.128318584070796
S-S2	Tyr-GTA-1	0.125516834022445
S-S1	apiTyr-GTA-1	0.125
S-R2	Met-CAT-1	0.124335812964931
S-T2	Gln-TTG-1	0.124183006535948
S-T1	Ser-AGA-1	0.123994638069705
S-T2	Ser-TGA-1	0.123907145010552
S-R1	Leu-CAA-1	0.122977346278317
S-R2	Ser-AGA-1	0.120813397129187
S-S2	Asn-GTT-1	0.120500562429696
S-R2	Asn-GTT-1	0.119802894979982
S-R2	Leu-AAG-1	0.118929633300297
S-R2	Gln-TTG-1	0.116087344028521
S-T1	apiAla-TGC-1	0.115384615384615
S-S2	Arg-CCT-1	0.114425981873112
S-T2	Ala-TGC-1	0.113581075413136
S-T1	Leu-CAA-1	0.113553113553114
S-S2	apiMet-CAT-2	0.112676056338028
S-S1	Ser-TGA-1	0.111308993766696
S-R2	apiCys-GCA-1	0.111111111111111
S-T1	apiCys-GCA-1	0.111111111111111
S-R2	Arg-CCT-1	0.110785463071512
S-R2	Tyr-GTA-1	0.110458284371328
S-R2	Pro-AGG-1	0.110453648915187
S-S2	Ala-TGC-1	0.109989701338826
S-S2	Gln-TTG-1	0.10846885547714
S-R2	Ser-TGA-1	0.107991360691145
S-S2	iMet-CAT-1	0.107887796691441
S-R2	Gly-GCC-1	0.105846320151338
S-R1	Pro-AGG-1	0.105691056910569
S-T2	Leu-CAA-1	0.105430183356841
S-S2	apiCys-GCA-1	0.103896103896104
S-S2	Leu-CAA-1	0.101728723404255
S-S1	Cys-GCA-1	0.0980565371024735
S-T2	Pro-AGG-1	0.0950692877860135
S-T1	Pro-AGG-1	0.0931333859510655
S-R2	Ala-TGC-1	0.090800159765677
S-R2	Leu-CAA-1	0.0906183368869936
S-S2	Ser-TGA-1	0.0873313343328336
S-R2	iMet-CAT-1	0.0872908186341022
S-R1	Cys-GCA-1	0.079296875
S-S1	Pro-AGG-1	0.0781627719580983
S-S2	Pro-AGG-1	0.0753747323340471
S-T1	Cys-GCA-1	0.0746775288526816
S-T2	Cys-GCA-1	0.0693282636248416
S-S2	Cys-GCA-1	0.0667945587722358
S-R2	Cys-GCA-1	0.0631717481903926
S-R1	apiArg-ACG-1	NA
S-R1	apiAsp-GTC-1	NA
S-R1	apiThr-TGT-1	NA
S-R2	apiIle-GAT-1	NA
S-T1	apiArg-ACG-1	NA
S-T1	apiIle-GAT-1	NA
S-T1	apiSer-GCT-1	NA
S-T2	apiMet-CAT-1	NA