SampleID	chrom	degradation_ratio
S-T2	apiPro-TGG-1	0.764705882352941
S-R1	apiGly-ACC-1	0.75
S-R1	apiSer-GCT-1	0.75
S-S1	apiSer-GCT-1	0.75
S-T1	apiMet-CAT-1	0.666666666666667
S-T2	apiGlu-TTC-1	0.625
S-T2	apiGly-ACC-1	0.615384615384615
S-R1	apiArg-TCT-1	0.6
S-R1	apiIle-GAT-1	0.6
S-R2	apiLeu-TAG-1	0.6
S-T1	apiVal-TAC-1	0.6
S-R1	apiSer-TGA-1	0.571428571428571
S-S2	apiSer-GCT-1	0.571428571428571
S-S2	apiMet-CAT-1	0.538461538461538
S-R1	apiLeu-TAG-1	0.5
S-R2	apiAsp-GTC-1	0.5
S-R2	apiPhe-GAA-1	0.5
S-S1	apiGlu-TTC-1	0.5
S-T1	apiGly-TCC-1	0.5
S-T2	apiAsp-GTC-1	0.5
S-T2	SeC-TCA-1	0.47029702970297
S-R2	apiGlu-TTC-1	0.461538461538462
S-T2	apiHis-GTG-1	0.461538461538462
S-S1	apiGly-ACC-1	0.441176470588235
S-T1	apiGlu-TTC-1	0.428571428571429
S-T2	apiTrp-CCA-1	0.428571428571429
S-R1	apiAla-TGC-1	0.421052631578947
S-R1	apiTrp-CCA-1	0.4
S-R1	apiTyr-GTA-1	0.4
S-R2	apiSer-GCT-1	0.4
S-S1	apiPhe-GAA-1	0.4
S-T1	apiLeu-TAG-1	0.4
S-T2	apiPhe-GAA-1	0.4
S-T2	apiSer-TGA-1	0.4
S-T2	apiVal-TAC-1	0.4
S-T1	SeC-TCA-1	0.395209580838323
S-R1	apiPhe-GAA-1	0.391304347826087
S-R1	apiLys-TTT-1	0.384615384615385
S-R1	apiPro-TGG-1	0.384615384615385
S-R1	SeC-TCA-1	0.382352941176471
S-S1	His-GTG-1	0.379374110953058
S-S1	apiArg-ACG-1	0.375
S-S1	apiIle-GAT-1	0.375
S-T2	apiCys-GCA-1	0.375
S-S2	apiPhe-GAA-1	0.373134328358209
S-T2	apiAla-TGC-1	0.368421052631579
S-T2	Thr-TGT-1	0.368243243243243
S-T1	apiGly-ACC-1	0.363636363636364
S-T1	apiPro-TGG-1	0.363636363636364
S-T2	apiLys-TTT-1	0.363636363636364
S-S1	SeC-TCA-1	0.361111111111111
S-S1	apiHis-GTG-1	0.36
S-R2	apiAsn-GTT-1	0.358974358974359
S-S2	apiHis-GTG-1	0.358974358974359
S-S1	Arg-TCT-1	0.357597816196542
S-S2	His-GTG-1	0.355536877495272
S-R1	His-GTG-1	0.352889972144847
S-T2	His-GTG-1	0.351587047130491
S-S1	Thr-TGT-1	0.35
S-R1	Ala-AGC-1	0.346846846846847
S-T2	Ile-AAT-1	0.344621513944223
S-R1	Lys-CTT-1	0.344329896907216
S-T1	His-GTG-1	0.341154261057174
S-S1	apiPro-TGG-1	0.34
S-R1	apiGly-TCC-1	0.333333333333333
S-R1	apiHis-GTG-1	0.333333333333333
S-R1	apiMet-CAT-1	0.333333333333333
S-R1	apiVal-TAC-1	0.333333333333333
S-R2	apiArg-ACG-1	0.333333333333333
S-R2	apiSer-TGA-1	0.333333333333333
S-S1	apiLeu-TAG-1	0.333333333333333
S-S1	apiVal-TAC-1	0.333333333333333
S-T2	apiArg-ACG-1	0.333333333333333
S-T2	apiArg-TCT-1	0.333333333333333
S-T2	apiIle-GAT-1	0.333333333333333
S-T2	apiLeu-TAG-1	0.333333333333333
S-R1	Ile-TAT-1	0.329545454545455
S-R1	Ala-CGC-1	0.329268292682927
S-R1	Arg-TCT-1	0.327731092436975
S-S1	Val-AAC-1	0.327256558470431
S-S1	apiTrp-CCA-1	0.325581395348837
S-R2	apiPro-TGG-1	0.324324324324324
S-T2	Lys-CTT-1	0.323488045007032
S-S1	apiThr-TGT-1	0.32
S-T1	Lys-CTT-1	0.318068276436303
S-T1	Ile-AAT-1	0.317073170731707
S-S1	Lys-CTT-1	0.316666666666667
S-S1	Ala-AGC-1	0.315736040609137
S-R1	apiAsn-GTT-1	0.3125
S-R2	His-GTG-1	0.310065756196257
S-T2	Arg-TCT-1	0.308233638282899
S-T1	Arg-TCT-1	0.307736389684814
S-R2	SeC-TCA-1	0.306451612903226
S-T1	Thr-TGT-1	0.305418719211823
S-S1	apiMet-CAT-2	0.304878048780488
S-S1	Trp-CCA-1	0.304477611940298
S-T1	Ile-TAT-1	0.304147465437788
S-T2	Ile-TAT-1	0.30225988700565
S-R2	apiArg-TCT-1	0.3
S-S1	apiAsp-GTC-1	0.3
S-T2	apiThr-TGT-1	0.3
S-S2	apiTyr-GTA-1	0.297297297297297
S-R2	apiGly-ACC-1	0.296296296296296
S-S1	apiSer-TGA-1	0.296296296296296
S-T1	Ala-AGC-1	0.295196506550218
S-S2	apiTrp-CCA-1	0.294117647058824
S-S1	Glu-CTC-1	0.290100183130453
S-S1	Thr-CGT-1	0.289156626506024
S-R1	Thr-TGT-1	0.2875
S-R1	apiMet-CAT-2	0.285714285714286
S-R2	apiVal-TAC-1	0.285714285714286
S-T1	apiHis-GTG-1	0.285714285714286
S-T2	apiGly-TCC-1	0.285714285714286
S-R1	Thr-CGT-1	0.283236994219653
S-S1	apiAla-TGC-1	0.282051282051282
S-S2	apiThr-TGT-1	0.28169014084507
S-S1	Arg-TCG-1	0.281496062992126
S-S2	Arg-TCT-1	0.281109185441941
S-T1	Ala-CGC-1	0.27906976744186
S-R1	Trp-CCA-1	0.27891156462585
S-S1	Ala-CGC-1	0.277777777777778
S-S2	apiLeu-TAG-1	0.277777777777778
S-T1	apiPhe-GAA-1	0.277777777777778
S-S1	Ile-TAT-1	0.276785714285714
S-S2	Val-AAC-1	0.274971075973776
S-R2	apiTyr-GTA-1	0.272727272727273
S-R2	Ile-TAT-1	0.272108843537415
S-S2	Thr-TGT-1	0.271966527196653
S-S2	apiAsn-GTT-1	0.267716535433071
S-S2	SeC-TCA-1	0.266891891891892
S-R2	apiThr-TGT-1	0.266666666666667
S-R2	apiAla-TGC-1	0.265822784810127
S-T2	Ala-AGC-1	0.265011119347665
S-T1	Trp-CCA-1	0.264248704663212
S-S2	apiAsp-GTC-1	0.263157894736842
S-S2	apiPro-TGG-1	0.263157894736842
S-T1	Val-AAC-1	0.26307346807828
S-R1	Glu-CTC-1	0.261848341232227
S-T1	apiMet-CAT-2	0.260869565217391
S-S2	Ile-TAT-1	0.260176991150442
S-R2	apiGly-TCC-1	0.259259259259259
S-S1	apiAsn-GTT-1	0.256756756756757
S-R1	Val-AAC-1	0.25615763546798
S-R2	Arg-TCT-1	0.2534046692607
S-R1	apiGln-TTG-1	0.25
S-S1	apiMet-CAT-1	0.25
S-S2	apiArg-TCT-1	0.25
S-T1	apiAsn-GTT-1	0.25
S-T1	apiAsp-GTC-1	0.25
S-T1	apiSer-TGA-1	0.25
S-T1	apiTyr-GTA-1	0.25
S-S2	Trp-CCA-1	0.249845392702536
S-T1	Arg-ACG-1	0.248898678414097
S-T2	Trp-CCA-1	0.246958089229383
S-S1	apiLys-TTT-1	0.24390243902439
S-S2	Thr-CGT-1	0.243523316062176
S-S2	apiAla-TGC-1	0.243093922651934
S-S2	Lys-CTT-1	0.242625368731563
S-S1	apiArg-TCT-1	0.24
S-S2	Ala-CGC-1	0.24
S-S2	apiSer-TGA-1	0.238095238095238
S-T2	Val-AAC-1	0.236471692211448
S-S1	apiGln-TTG-1	0.235294117647059
S-S2	apiGlu-TTC-1	0.235294117647059
S-S2	Ala-AGC-1	0.235261401557286
S-S1	Leu-TAA-1	0.234342012667136
S-S2	apiGln-TTG-1	0.233766233766234
S-R2	Val-AAC-1	0.231633986928105
S-T1	Glu-CTC-1	0.231278859666734
S-T2	apiMet-CAT-2	0.230769230769231
S-T2	Ala-CGC-1	0.229411764705882
S-S2	apiGly-ACC-1	0.228070175438596
S-R1	Thr-AGT-1	0.225997045790251
S-R2	apiLys-TTT-1	0.225806451612903
S-T2	Glu-CTC-1	0.224674464798058
S-S2	Glu-CTC-1	0.224331616384597
S-T1	apiArg-TCT-1	0.222222222222222
S-S1	Thr-AGT-1	0.222085889570552
S-S1	Met-CAT-1	0.220779220779221
S-T1	Leu-TAA-1	0.220464135021097
S-S1	Gly-TCC-1	0.219759926131117
S-R1	Arg-TCG-1	0.218421052631579
S-T1	Thr-AGT-1	0.21492295214923
S-R2	Thr-TGT-1	0.21455938697318
S-R2	Lys-CTT-1	0.213286713286713
S-R2	Ala-AGC-1	0.211475894705708
S-R2	Trp-CCA-1	0.207837648705388
S-S1	apiCys-GCA-1	0.206896551724138
S-T2	Arg-ACG-1	0.205248359887535
S-R2	Ala-CGC-1	0.203636363636364
S-R1	Leu-TAA-1	0.203508771929825
S-S1	Gly-GCC-1	0.203489640130862
S-R1	Met-CAT-1	0.20253164556962
S-R1	Asp-GTC-1	0.201531833413116
S-T2	Asp-GTC-1	0.200281006514242
S-R1	apiCys-GCA-1	0.2
S-R1	apiGlu-TTC-1	0.2
S-S2	apiGly-TCC-1	0.2
S-S2	apiVal-TAC-1	0.2
S-T1	apiLys-TTT-1	0.2
S-T2	apiAsn-GTT-1	0.2
S-S2	Leu-TAA-1	0.199772123053551
S-S1	Asp-GTC-1	0.198096532970768
S-R2	Glu-CTC-1	0.19806833979659
S-R2	Thr-CGT-1	0.197696737044146
S-R2	apiMet-CAT-2	0.196969696969697
S-T1	Leu-CAG-1	0.195729537366548
S-T1	Thr-CGT-1	0.193989071038251
S-T1	Met-CAT-1	0.193548387096774
S-T2	Gly-TCC-1	0.192513368983957
S-S2	Gly-TCC-1	0.190662865288667
S-R1	Gly-TCC-1	0.190328820116054
S-R1	Ser-CGA-1	0.18796992481203
S-R2	apiHis-GTG-1	0.1875
S-T2	Leu-TAA-1	0.186574531095755
S-S1	Ser-CGA-1	0.185882352941176
S-S1	Tyr-GTA-1	0.18557336621455
S-S2	Asp-GTC-1	0.184148290188559
S-T2	Thr-AGT-1	0.183987274655355
S-S2	apiLys-TTT-1	0.183908045977011
S-T1	Arg-TCG-1	0.183123877917415
S-R1	Asn-GTT-1	0.182773109243697
S-R1	Arg-CCT-1	0.18273381294964
S-R1	Gln-CTG-1	0.182222222222222
S-T1	apiTrp-CCA-1	0.181818181818182
S-T2	Thr-CGT-1	0.181102362204724
S-R2	Ile-AAT-1	0.180616740088106
S-T1	Gln-CTG-1	0.180242634315425
S-S2	Arg-ACG-1	0.18
S-T1	Gly-TCC-1	0.179667955424153
S-S2	apiIle-GAT-1	0.179487179487179
S-R1	Ile-AAT-1	0.178571428571429
S-S1	Leu-CAG-1	0.177606177606178
S-S1	Arg-ACG-1	0.176678445229682
S-R1	Arg-ACG-1	0.176308539944904
S-R1	iMet-CAT-1	0.175879396984925
S-T1	Ser-CGA-1	0.175029171528588
S-R2	apiGln-TTG-1	0.173913043478261
S-T2	Arg-TCG-1	0.17377812257564
S-S1	Phe-GAA-1	0.173657100809419
S-T2	Met-CAT-1	0.173240525908739
S-S2	Arg-TCG-1	0.173221757322176
S-T2	Leu-AAG-1	0.1727781230578
S-T2	Ser-CGA-1	0.172631578947368
S-T1	Leu-AAG-1	0.172335600907029
S-R1	Gln-TTG-1	0.170062001771479
S-R1	Leu-CAG-1	0.168674698795181
S-R1	Phe-GAA-1	0.168458781362007
S-S2	Thr-AGT-1	0.168409466152999
S-S1	Asn-GTT-1	0.167349327091867
S-S1	Gln-TTG-1	0.167233174711081
S-S1	apiGly-TCC-1	0.166666666666667
S-T1	apiThr-TGT-1	0.166666666666667
S-T2	apiTyr-GTA-1	0.166666666666667
S-S1	Ser-GCT-1	0.166077080618134
S-S2	Ile-AAT-1	0.164983164983165
S-R2	Gln-CTG-1	0.164978292329957
S-T1	Asp-GTC-1	0.164774470696533
S-T1	iMet-CAT-1	0.161655773420479
S-R1	Leu-AAG-1	0.161369193154034
S-R2	Arg-TCG-1	0.161008729388943
S-T1	Phe-GAA-1	0.160714285714286
S-R2	apiTrp-CCA-1	0.16
S-S2	Met-CAT-1	0.158461538461538
S-S1	Gln-CTG-1	0.157349896480331
S-R2	Asp-GTC-1	0.156335112757381
S-S1	Ser-AGA-1	0.15609022556391
S-S1	iMet-CAT-1	0.155940594059406
S-S1	Arg-CCT-1	0.155330882352941
S-R2	Ser-CGA-1	0.154772937905468
S-T2	Leu-CAG-1	0.154198473282443
S-T1	apiGln-TTG-1	0.153846153846154
S-T2	Ser-AGA-1	0.153571428571429
S-S2	Leu-CAG-1	0.153310104529617
S-T2	Gln-CTG-1	0.152388797364086
S-R2	Arg-ACG-1	0.152
S-R1	Ser-GCT-1	0.151748666271488
S-S2	Ser-CGA-1	0.151424287856072
S-S1	Leu-CAA-1	0.150696150696151
S-R2	Gly-TCC-1	0.150354153251771
S-R1	Ser-AGA-1	0.148313176320815
S-T2	iMet-CAT-1	0.147860962566845
S-R2	Leu-CAG-1	0.146341463414634
S-T1	Tyr-GTA-1	0.145048814504881
S-S1	Ala-TGC-1	0.144792360648457
S-T2	Phe-GAA-1	0.144578313253012
S-T1	Asn-GTT-1	0.143978164448994
S-T2	apiGln-TTG-1	0.142857142857143
S-T2	Ser-GCT-1	0.14123683499865
S-T2	Arg-CCT-1	0.140798952193844
S-S2	Gly-GCC-1	0.140435368907725
S-S1	Leu-AAG-1	0.138089758342923
S-T1	Arg-CCT-1	0.137382501807665
S-S2	Leu-AAG-1	0.136781609195402
S-T1	Gly-GCC-1	0.136502328569134
S-R1	Gly-GCC-1	0.136040609137056
S-R1	Ser-TGA-1	0.136038186157518
S-R2	Phe-GAA-1	0.135946885867847
S-T2	Asn-GTT-1	0.135636596289187
S-T1	Ser-GCT-1	0.134727272727273
S-T1	Ser-TGA-1	0.134060795011691
S-R2	Thr-AGT-1	0.133202099737533
S-S2	Ser-GCT-1	0.133063864187551
S-T2	Gly-GCC-1	0.132859109683341
S-S2	Gln-CTG-1	0.131641554321967
S-R1	Tyr-GTA-1	0.130750605326877
S-S2	Phe-GAA-1	0.130325329202169
S-R2	Ser-GCT-1	0.1297632611723
S-S2	Ser-AGA-1	0.12918154171625
S-T1	Gln-TTG-1	0.128264654672084
S-R2	Leu-TAA-1	0.127205882352941
S-T2	Tyr-GTA-1	0.126363956353397
S-T1	Ala-TGC-1	0.12629246676514
S-S1	Ile-AAT-1	0.126168224299065
S-R1	Ala-TGC-1	0.126143609647907
S-S1	apiTyr-GTA-1	0.125
S-T2	Gln-TTG-1	0.123705722070845
S-T2	Ser-TGA-1	0.123642943305187
S-T1	Ser-AGA-1	0.123407109322602
S-S2	Tyr-GTA-1	0.121625630376743
S-R2	Met-CAT-1	0.121535181236674
S-R2	Ser-AGA-1	0.120603015075377
S-R1	Leu-CAA-1	0.12012987012987
S-R2	Leu-AAG-1	0.117179741807349
S-R2	Gln-TTG-1	0.115496098104794
S-T1	apiAla-TGC-1	0.115384615384615
S-S2	Asn-GTT-1	0.114649681528662
S-S2	Arg-CCT-1	0.114091424253872
S-S2	apiMet-CAT-2	0.112676056338028
S-R2	Asn-GTT-1	0.112422360248447
S-T2	Ala-TGC-1	0.111718224613315
S-R2	apiCys-GCA-1	0.111111111111111
S-T1	apiCys-GCA-1	0.111111111111111
S-S1	Ser-TGA-1	0.110516934046346
S-T1	Leu-CAA-1	0.110294117647059
S-R2	Arg-CCT-1	0.110263929618768
S-R2	Pro-AGG-1	0.109135802469136
S-R2	Tyr-GTA-1	0.108362779740872
S-S2	Ala-TGC-1	0.108336772595955
S-S2	Gln-TTG-1	0.108195211786372
S-R2	Ser-TGA-1	0.107605877268799
S-S2	iMet-CAT-1	0.106173432620706
S-R1	Pro-AGG-1	0.105691056910569
S-R2	Gly-GCC-1	0.105443403028118
S-S2	apiCys-GCA-1	0.103896103896104
S-S2	apiArg-ACG-1	0.103448275862069
S-T2	Leu-CAA-1	0.103216684340756
S-S2	Leu-CAA-1	0.100532623169108
S-S1	Cys-GCA-1	0.0960602036299247
S-T2	Pro-AGG-1	0.0941935483870968
S-T1	Pro-AGG-1	0.0902612826603325
S-R2	Ala-TGC-1	0.0892237930114697
S-R2	Leu-CAA-1	0.0867237687366167
S-S2	Ser-TGA-1	0.0866466616654164
S-R2	iMet-CAT-1	0.085222121486854
S-S1	Pro-AGG-1	0.0766747376916868
S-R1	Cys-GCA-1	0.07641065830721
S-S2	Pro-AGG-1	0.0749785775492716
S-T1	Cys-GCA-1	0.0721579305650102
S-T2	Cys-GCA-1	0.068028937682447
S-S2	Cys-GCA-1	0.0656539200279378
S-R2	Cys-GCA-1	0.061937184274105
S-R1	apiArg-ACG-1	NA
S-R1	apiAsp-GTC-1	NA
S-R1	apiThr-TGT-1	NA
S-R2	apiIle-GAT-1	NA
S-R2	apiMet-CAT-1	NA
S-T1	apiArg-ACG-1	NA
S-T1	apiIle-GAT-1	NA
S-T1	apiSer-GCT-1	NA
S-T2	apiMet-CAT-1	NA
S-T2	apiSer-GCT-1	NA